Tréflaouenan, en breton Trelaouenan, est attesté en 1446 dans la réformation des fouages sous la forme Trefflouenan. Nous pourrons retrouver ce forme ancienne de ce toponyme en 1516 vec un Treffloenan puis un Trefflaouenan en 1534 (?) qui sera confirmé avec un Treflauenan en 1557. Les archives départementales du Finistère, source toponymique précieuse, nous proposent un Trelaouenan en 1587, un Trefflaouenan en 1613, un Treflaoenan en 1644 puis un Treflaouenan en 1673. Les registres paroissiaux de Lambézellec nous dévoileront un Trelauuenan en 1694 suivi d'un Trelaoüénan en 1712 retrouvé dans le registre paroissial de Plouzévédé.
Ce toponyme dérive de Tref- désignant une paroisse ou, aux origines, une entité administrative bretonne originelle et Laouenan, saint disciple de Saint Pol Aurélien, ou pentiern, chef breton ayant marqué ce territoire de sa stature.
