Nous pouvons découvrir ce toponyme de Neuffontaines au XIII° siècle dans le Pouillé d'Autun sous sa forme latine Novem fontanas que nous retrouverons sous la forme de Novenfontes au XIV° siècle dans ce même pouillé.
Le terrier de Chitry sous offre un Lespitaul de Neuffontaines rappelant l'existence en ces lieux d'une léproserie maintenant disparue.
Ce toponyme, signifiant Neuf - 9 Fontaines, pose la question de savoir quelles sont ces fontaines ?
Il est probable - la châtellenie de Neuffontaines étant l'une des châtellenie primitive du Comté de Nevers, qu'elles correspondent aux fontaines des hameaux et lieux habités en ces temps lointains.