Nous retrouvons Béon dans le pouillé du diocèse de Genève en 1344 sous une forme identique avec un Béons que nous retrouverons en 1670 avec Béon qui reste inchangé jusqu'à ce jour.
Nous n'avons pas retrouvé de formes anciennes permettant de relier ce toponyme à quelque sens avec certitude.
Certains relient ce toponyme à un anthroponyme germanique, Baio, Baion. Un mot latin Běo signifiant heureux, rendre heureux serait-il piste possible ?