Quiberon, en breton Kiberen, est attesté en l'an 1037 dans le Cartulaire de l'abbaye de Redon sous la forme Keberoen. Nous le retrouvons sous une forme proche dans le Cartulaire de Saint-Croix en Quimperlé sous la forme Keperoen.
L'étymologie de ce toponyme reste pleine d'interrogations et semble d'origine pré-bretonne. Nombre d'îles bretonnes ne furent pas renommées par les bretons lors de leur arrivée sur la péninsule armoricaine' et gardèrent leur ancien toponyme. Si cette remarque est aussi valable pour des îles comme Houat, Hoedic, Belle-île, Sein et Ouessant dont l'appellation actuelle dérive des noms retrouvés dans l'Itinéraire d'Antonin ou sur les Tables de Peutinger, elle est aussi valable pour nombre d'oronymes et d'hydronymes qui gardent une grande stabilité dans le temps.